Technician in Artificial Intelligence and computational drug discovery

De faculteit der Wiskunde en Natuurwetenschappen en het Leiden Academic Center for Drug Research zijn op zoek naar een

Analist in Artificiële Intelligentie en Computationeel medicijnontwikkeling (0.8-1.0 fte)

Project Beschrijving
Binnen het Leiden Academic Centre for Drug Research (LACDR), onderdeel van de Faculteit der Wiskunde en Natuurwetenschappen, zijn wij op zoek naar een analist op het gebied van AI en computationele medicijnontwikkeling. Het onderzoek binnen onze afdeling Medicinal Chemistry richt zich op het ontwikkelen van tools ter verbetering van het medicijnontwikkelingsproces. Deze vacature bevindt zich in de PI-groep Computational Drug Discovery (CDD) en is ingebed in het nationale groeifondsproject Oncode Accelerator, specifiek in het AI-platform.

De CDD-groep werkt op het snijvlak van medicinale chemie en computationele wetenschappen en past innovatieve AI-algoritmen toe op chemische en biologische data. Daarnaast zijn er nauwe samenwerkingen met andere PI-groepen, waardoor synthese en biologische tests van door AI ontworpen moleculen mogelijk zijn.

Het Oncode Accelerator AI-platform zal AI-tools ontwikkelen, trainen en verifiëren, die vervolgens door de gehele preklinische ontwikkelketen worden toegepast in nauwe samenwerking met 5 academische en 7 commerciële partners. Het doel is het optimaliseren en versnellen van de ontwikkeling van nieuwe kankertherapieën door in een vroeg stadium patiëntdata en -materiaal, organoïde modellen en AI te integreren in het preklinische ontwikkelproces.

De analist zal verantwoordelijk zijn voor de ondersteuning van door Oncode Accelerator ontwikkelde tools en data in lopende projecten. Daarnaast omvat de functie de volgende taken en verantwoordelijkheden:

• Toepassen en integreren van state-of-the-art computationele tools in het medicijnontwikkelingsproces binnen de Oncode Accelerator-consortia
• Ontwikkeling en onderhoud van bestaande, op Python gebaseerde machine learning-modellen
• Deelname aan de data management-groep van het Oncode Accelerator AI-platform
• Aanleren en toepassen van nieuwe computationele methoden en instrumenten
• Schrijven van handleidingen en protocollen voor promovendi en studenten
• Updaten en patchen van computationele servers
• Het geven van feedback aan leden van de CDD-groep
• Ondersteunen van studenten, promovendi, postdocs en andere medewerkers in een high-performance computationele omgeving
• Het instrueren van Bachelor-, Master- en PhD-studenten in werkwijzen en procedures

Uw profiel 
U heeft een HBO-of WO-bachelor opleiding in (bio/chem)informatica, of een relevant computationeel vakgebied.

Aanvullende vereisten

• Uitstekende beheersing van de Engelse taal (zowel mondeling als schriftelijk)
• Beheersing van Python en Bash
• Kennis van data-integriteit en data-management
• Creatieve, zelfstandige en communicatieve teamspeler met een “getting things done”-mentaliteit
• Ervaring met machine learning is een pluspunt
   

Beschrijving faculteit/instituut
De Leidse Faculteit der Wiskunde en Natuurwetenschappen is een faculteit van wereldklasse waar medewerkers en studenten samenwerken in een dynamische, internationale omgeving. Onze mensen worden gedreven door nieuwsgierigheid om fundamentele kennis uit te breiden en verder te kijken dan de grenzen van hun eigen discipline.

Het onderzoek aan de Faculteit der Wiskunde en Natuurwetenschappen is divers en varieert van kunstmatige intelligentie, computerwetenschappen, wiskunde, sterrenkunde, natuurkunde, scheikunde en biofarmaceutische wetenschappen tot biologie en milieuwetenschappen. De faculteit is de afgelopen jaren sterk gegroeid en telt nu meer dan 2.300 medewerkers en bijna 5.000 studenten. We zijn gevestigd in het hart van het Leiden Bio Science Park, een van de grootste scienceparken van Europa, waar universiteit en bedrijfsleven samenkomen. Voor meer informatie, zie http://www.science.leidenuniv.nl. 

Leiden Academic Centre for Drug Research
Het Leiden Academic Centre for Drug Research (LACDR) is een van de top instituten in multidisciplinair onderzoek naar geneesmiddelen. De Universiteit Leiden staat wereldwijd consequent in de top 20 van de QS-ranking voor Farmacologie en Farmacie. Bij het LACDR ontwikkelen we innovatieve wetenschappelijke concepten in fundamenteel en translationeel onderzoek die ten grondslag liggen aan de ontdekking en optimalisatie van geneesmiddelen en gepersonaliseerde medicijnen. We streven ernaar de route naar nieuwe geneesmiddelen te optimaliseren die zowel effectief als veilig zijn. Daarom richt ons onderzoek zich op geneesmiddelenontdekking en -veiligheid, bio-therapeutica, en systeem-biomedicine en farmacologie. Geavanceerde expertise en infrastructuren zorgen ervoor dat wij strategisch gepositioneerd zijn binnen (inter)nationale samenwerkingen, wat de ontwikkeling en toepassing van nieuwe concepten in klinische en industriële omgevingen versterkt. Het instituut heeft een sterke focus op computationele methoden binnen het geneesmiddelenontdekkingsproces, zoals blijkt uit de aanwezigheid van drie computationele PI-groepen.

LACDR heeft nauwe, lopende samenwerkingen met het Leids Universitair Medisch Centrum (LUMC) en het Centre for Human Drug Research (CHDR). Meer informatie over het LACDR is te vinden op https://www.universiteitleiden.nl/en/science/drug-research. 

Divisie Medicinale Chemie
De divisie Medicinale Chemie binnen het LACDR combineert een moleculair begrip van de interactie tussen kleine moleculen en hun eiwitdoelen met cheminformatica voor de ontwikkeling van nieuwe en veilige geneesmiddelenkandidaten. De divisie beschikt over een high-performance computercluster, een state-of-the-art 3D-faciliteit, een type C-radiolab en uitgebreide laboratoria voor medicinale chemie en moleculaire farmacologie.

Wij bieden
Aanstelling vindt plaats conform de cao Nederlandse Universiteiten. De aanstelling is in de eerste instantie voor een jaar en wordt na een succesvolle evaluatie verlengd tot maximaal 4 jaar. Het salaris is afhankelijk van opleiding en werkervaring, en bedraagt minimaal € 2.870,-  en maximaal € 3.771,-  bruto per maand bij een fulltime aanstelling (schaal 7). 

De Universiteit Leiden kent goede arbeidsvoorwaarden. Zo is er sprake van een thuiswerkvergoeding, een eindejaarsuitkering (8,3%), een vakantietoeslag (8%), uitstekende opleidingsfaciliteiten en de mogelijkheid om via een keuzemodel arbeidsvoorwaarden op maat te kiezen. (https://www.universiteitleiden.nl/werken-bij/sollicitatieprocedure-en-arbeidsvoorwaarden) 

Diversiteit
Het bevorderen van een inclusieve gemeenschap staat centraal in de waarden en visie van de Universiteit Leiden. De Universiteit Leiden streeft ernaar om een inclusieve gemeenschap te worden die alle studenten en medewerkers in staat stelt om zich gewaardeerd en gerespecteerd te voelen en zich volop te ontplooien. Diversiteit in ervaringen en perspectieven verrijkt ons onderwijs en versterkt ons onderzoek. Onderwijs en onderzoek van hoge kwaliteit is inclusief.

Informatie 
Voor meer informatie over de inhoud van deze functie kun je contact opnemen met:
Nicole van Zaal , n.van.zaal@lacdr.leidenuniv.nl 
Prof. Dr. GJP van Westen , gerard@lacdr.leidenuniv.nl

Solliciteren
Direct solliciteren? Klik dan op de sollicitatiebutton. Sollicitaties voorzien van een motivatiebrief, CV met indien aanwezig een lijst van publicaties, en een kopie van het BSc / MSc diploma met cijferlijst kunnen tot uiterlijk 31 Januari 2025 worden gericht aan Prof. Dr. GJP van Westen

Acquisitie naar aanleiding van deze vacature wordt niet op prijs gesteld.